VizIt让单细胞、空间和基因数据在线多视角联动探索
VizIt: A multi-view framework for exploring single-cell, spatial, and genetic data online
- 构建基因、细胞类型、空间位置等多视角联动的交互框架
- 在帕金森病细胞图谱中实现多组学数据无缝切换与分析
- 适合生物信息学研究者快速探索复杂多组学数据
多组学研究日益需要从互补的生物学视角审视数据，但交互式探索仍分散于不同模态和工具。我们提出 VizIt，一个开源框架，支持单细胞、空间转录组、表观遗传和遗传数据的多视图探索。VizIt 将基因、细胞类型、条件、空间、基因组区域和变异中心视图相连接，实现跨生物学视角的无缝导航。我们通过帕金森病细胞图谱（Parkinson's Cell Atlas）展示了 VizIt 的能力，该图谱是一个可定制的交互式多组学资源。
原文摘要 · Abstract (English)
Multi-omic studies increasingly require data to be examined from complementary biological perspectives, yet interactive exploration remains fragmented across modalities and tools. We present VizIt, an open-source framework for multi-view exploration of single-cell and spatial transcriptomic, epigenomic and genetic data. VizIt connects gene-, cell type-, condition-, spatial-, genomic region- and variant-centered views, enabling seamless navigation across biological perspectives. We demonstrate VizIt through the Parkinson's Cell Atlas, a customizable interactive multi-omic resource.
Thank you to arXiv for use of its open access interoperability. PaperDance 不是 arXiv 官方产品；中文卡片由大模型生成，请以原文为准。